В состав Территориальной организации входят первичные профсоюзные организации следующих академических институтов:
- Инстутут Аграрных проблем РАН
- Институт Проблем Точной Механики и Управления РАН
- Саратовский филиал Института радиотехники и электроники им. В.А. Котельникова РАН
- Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
- Саратовский филиал Института проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова
- Саратовский научный центр РАН
- Отдел энергетических проблем ФИЦ СНЦ РАН
С декабря 2021 года все академические институты Саратова, имеющие статус самостоятельных юридических лиц, были объединены в Федеральный исследовательский центр.